Do warszawskiego klubu Komorowski trafił zimą 2009 roku z Polonii Bytom. Początkowo był głównie piłkarzem rezerwowym. W pierwszym składzie regularnie zaczął grać u Macieja Skorży. Ten szkoleniowiec przesunął 27-letniego piłkarza na środek obrony.
Marcin Komorowski w trakcie zimowego okna transferowego otrzymał ofertę z ligi chińskiej. Jednak nie przyjął jej i postanowił nadal występować w Legii.
Tabela Ekstraklasy po sobotnich meczach. Widzew wyskoczył ze strefy spadkowej
Sobotnie mecze 21. kolejki PKO BP Ekstraklasa dobiegły końca. Jagiellonia nieznacznie powiększa przewagę nad Wisłą Płock, jednak nie ma zbyt wielkich zmian w notowaniu.