Wilk występował podczas swojej kariery w takich klubach jak Lech Poznań, Lechia Gdańsk, Żalgiris Wilno, FC Vaslui i ostatnio właśnie Zagłębie. Na poziomie ekstraklasy rozegrał on 160 meczów, w których zdobył osiemnaście goli.
W obecnym sezonie rozegrał on dla Zagłębia czternaście spotkań, spędzając na boisku 557 minut. W tym czasie zdobył on jednego gola w Pucharze Polski.
Jakub Wilk został zawodnikiem Drutex-Bytovii. Witamy w klubie! Kontrakt obowiązywać będzie do końca czerwca 2018 roku.